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银行卡扣短信费时，一般会有通知。具体通知方式包括。
1、银行官方客服热线通知：银行会通过客服热线发送短信通知关于银行卡消费的短信通知，如果银行卡短信服务费被扣除了，银行会通过此方式通知持卡人。
2、对账单通知：银行每月会向持卡人发送对账单，其中会明确列出各项交易明细，包括被扣掉的短信服务费。
3、手机银行APP通知：如果持卡人安装了银行APP并绑定了银行卡，银行会通过这些渠道通知关于银行卡的各种信息，包括短信服务费的扣除情况。
银行卡扣短信费时，银行会通过多种方式通知持卡人，以确保客户了解交易明细，如果未能收到通知，建议及时联系银行客服进行查询，不过，具体的通知方式和时间可能会因银行政策和操作不同而有所差异。